CyVerse: La ciberinfraestructura que impulsa la ciencia abierta


ECMWF data centre, Bologna, Italy.
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ECMWF

En el vertiginoso mundo de la investigación científica moderna, donde los datos masivos y los análisis complejos se han convertido en el pan de cada día, surge una plataforma que promete transformar la manera en que los científicos abordan sus desafíos más apremiantes. Hablamos de CyVerse, una infraestructura computacional de vanguardia que está redefiniendo los límites de lo posible en las ciencias biológicas y más allá.

Nacida de la visión de democratizar el acceso a herramientas de análisis de datos de alto rendimiento, CyVerse ha recorrido un largo camino desde sus inicios como "The iPlant Collaborative" en 2008. Con una inversión pública de 117 millones de dólares hasta la fecha, representa el mayor esfuerzo en ciberinfraestructura para las ciencias biológicas en los Estados Unidos.

Pero, ¿qué hace que CyVerse sea tan especial? En esencia, esta plataforma actúa como un puente entre los científicos y las tecnologías de computación avanzada que necesitan para procesar y analizar conjuntos de datos cada vez más grandes y complejos. Imaginen un laboratorio virtual donde investigadores de todo el mundo pueden almacenar, compartir y analizar datos de manera colaborativa, sin importar su ubicación geográfica o su nivel de experiencia en programación.

Una de las características más destacadas de CyVerse es su CyVerse Data Store, una solución de almacenamiento basada en la nube que permite a los usuarios compartir conjuntos de datos y herramientas de análisis con colegas de todo el planeta. Esta capacidad de colaboración global se ve reforzada por la expansión internacional de CyVerse, con nodos en el Reino Unido que amplían aún más su alcance y potencial.

Pero CyVerse no se trata solo de almacenamiento. Su Entorno de Descubrimiento (DE) ofrece una suite completa de herramientas bioinformáticas que permiten a los usuarios visualizar datos, realizar análisis interactivos y personalizar sus flujos de trabajo de investigación. Esta flexibilidad ha atraído a una comunidad de usuarios en constante crecimiento, con más de 18,500 investigadores registrados que confían en CyVerse para impulsar sus proyectos.

El impacto de CyVerse en la comunidad científica es innegable. Con más de 1,695 artículos revisados por pares que citan la plataforma hasta 2023, y colaboraciones en más de 50 proyectos financiados externamente en los últimos cinco años, CyVerse se ha convertido en un pilar fundamental de la investigación moderna.

Pero quizás lo más impresionante de CyVerse es su compromiso con la democratización de la ciencia. Al proporcionar acceso a recursos de computación de alto rendimiento y en la nube, tanto públicos como comerciales, CyVerse está nivelando el campo de juego para investigadores de todo el mundo. Ya no es necesario ser un experto en programación o tener acceso a costosos recursos computacionales para realizar investigaciones de vanguardia.

Este enfoque en la accesibilidad se refleja en los esfuerzos educativos de CyVerse. Con 48 talleres profesionales impartidos a 1,670 investigadores desde 2017 y 141 seminarios web que han alcanzado a más de 7,100 asistentes, la plataforma está activamente formando la próxima generación de científicos de datos.

Sin embargo, el camino hacia adelante no está exento de desafíos. A medida que CyVerse se prepara para transicionar hacia un modelo de ingresos autosostenible, enfrenta la tarea de mantener el acceso equitativo a sus recursos, especialmente para grupos históricamente desatendidos. Además, debe adaptarse a las nuevas directrices federales sobre ciencia abierta y datos abiertos, al tiempo que desarrolla nuevas capacidades en áreas emergentes como la computación de borde y el Internet de las cosas.

A pesar de estos desafíos, el futuro de CyVerse parece brillante. Con un modelo de ingresos diversificado que incluye suscripciones, asociaciones con proyectos de investigación e implementaciones locales, la plataforma está bien posicionada para continuar su misión de democratizar la ciencia de datos y la computación de alto rendimiento.

En conclusión, CyVerse representa mucho más que una simple plataforma tecnológica. Es un catalizador para una nueva era de investigación colaborativa y reproducible, un faro de esperanza en un mundo científico cada vez más complejo y datificado. A medida que continuamos enfrentando desafíos globales que requieren soluciones basadas en datos, plataformas como CyVerse serán más cruciales que nunca. El futuro de la ciencia es colaborativo, es abierto, y gracias a CyVerse, está al alcance de todos.


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Referencia: Swetnam, T. L., Antin, P. B., Bartelme, R., Bucksch, A., Camhy, D., Chism, G., Choi, I., Cooksey, A. M., Cosi, M., Cowen, C., Culshaw-Maurer, M., Davey, R., Davey, S., Devisetty, U., Edgin, T., Edmonds, A., Fedorov, D., Frady, J., Fonner, J., … Lyons, E. (2024). CyVerse: Cyberinfrastructure for open science. PLoS Computational Biology, 20(2), e1011270. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1011270

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